该专业主要培养服务于医院、医药院校、医药科研单位、医药卫生管理部门、医疗仪器公司、生物制药企业、电子仪器公司、计算机软件公司，以及其它与医学工程相关的企业部门的工程师和管理人才。该专业从2002年开始招收本科生，目前的培养方向主要有两个：生物医学仪器和医学信息学，根据学生兴趣爱好和在校学习情况进行选择分流。目前就业率高，社会评价良好。开设的课程中大部分已经获评国家级或省级精品课程，具有雄厚的师资力量