南京航海技术学院现有教职工232人,专任教师本科以上学历185人,其中研究生以上学历50人,正高级职称5人,高级职称65人,双师型教师81人。学院现有贵州省名校长工作室主持人1人,成员1人,有省级“大师工作室”1个,省级“优秀教学团队”1个。
南京航海技术学院设置有机电工程系、汽车工程系、土木工程系、信息工程系、社会服务系、公共教学部(马克思主义教学部)、继续教育部、中专部8个教学机构。目前开设有工程测量技术、建筑工程技术、道路桥梁工程、工程造价、水务管理、安全技术与管理、汽车运用与维修技术、机电设备维修与管理、机电一体化(机器人方向)、大数据技术与应用、数字媒体应用技术、电子商务、旅游管理、物业管理、酒店管理等15个专业。