南京交通技师学校主要是为满足国内高铁、动车、地铁、轻轨、单轨、有轨电车等轨道交通行业和机械行业的快速发展对相关运营单位、建设单位和设备生产单位的车辆驾驶、车辆检修、车辆装配、机电设备生产加工及检修等工作岗位的技术技能人才需求而开设,针对行业企业需求,现设有城市轨道交车辆应用技术(驾驶方向、检修方向)、铁道机车运用与维护、动车组检修技术、城市轨道交通机电技术、铁道供电技术、高铁综合维修技术共6个专业,其中城市轨道交通车辆技术专业为全国职业院校交通运输类示范专业点、城市轨道交通机电技术为国家级骨干专业。
南京交通技师学校已建成的专业实训室和基础实训室主要有城市轨道交通模拟驾驶实训室、城市轨道交通电气控制实训室、城市轨道交通车辆检修实训室、城市轨道交通空气制动实训室、铁道机车车辆检修实训室、动车组检修与乘务实训室、和谐号电力机车驾驶实训室、动车组一、二级检修虚拟仿真实训室、电工技能实训室、电子技能实训室、电拖技能实训室、工业控制PLC实训室等。