湖北省城市轨道交通学校学院设有8个二级学院，设有马克思主义学院、公共课部和实训中心，开办33个专科专业。

铁道运输管理学院

铁道交通运营管理、城市轨道交通运营管理、高速铁路动车乘务

铁道机车车辆学院

铁道机车、动车组检修技术、铁道车辆、城市轨道交通车辆技术

铁道通信与信号学院

铁道信号自动控制、铁道通信与信息化技术、城市轨道交通通信信号技术、通信技术

铁道工程学院

高速铁道工程技术、铁道工程技术、城市轨道交通工程技术

机械与电子学院

机电设备维修与管理、城市轨道交通机电技术、应用电子技术、电子信息工程技术、电子工艺与管理

电气与自动化学院

铁道供电技术、供用电技术、电气自动化技术、城市轨道交通供配电技术

经济与管理学院

铁路物流管理、物流管理、电子商务、酒店管理、旅游管理、旅游英语、会计

医疗与护理学院

护理、助产、康复治疗技术